2009年1月23日 星期五

TUBERIN-Pattern and profile search


藉由MotifScan (http://myhits.isb-sib.ch/cgi-bin/motif_scan)分析TUBERIN的胺基酸序列,推測TUBERIN可能含有三種profile。由N端 (N-terminus) 至C端 (C-terminus) 分別為Phosphatase tensin-type domain profile、HEAT repeat profile與Rap GTPase activating proteins domain profile。其中前兩者位於接近N端的區域,後者則位於接近C端的區域。藉由GTPase activating domain,TUBERIN可活化下游蛋白質─Rheb─的GTPase活性,使其將攜帶的GTP分解成GDP,成為非活化態 (inactive)。

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